Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNB1P20700 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms