Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DPA1P20036 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms