Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME1P15531 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME1P15531 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms