Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF35P13682 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms