Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms