Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms