Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2AF1L5P0DN76 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms