Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2BP0DI82 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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