Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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