Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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PKHD1P08F94 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PKHD1P08F94 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PKHD1P08F94 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PKHD1P08F94 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PKHD1P08F94 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PKHD1P08F94 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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