Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOA4P06727 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOA4P06727 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOA4P06727 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA4P06727 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA4P06727 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA4P06727 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA4P06727 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA4P06727 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA4P06727 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOA4P06727 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms