Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK1P06493 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK1P06493 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK1P06493 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms