Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN9O95484 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms