Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms