Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms