Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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