Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNJ2O15056 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNJ2O15056 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms