Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN6O00399 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms