Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms