Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E9PBE3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E9PBE3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms