Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SSPOA2VEC9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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