Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms