Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP1Q9Y3L3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms