Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED16Q9Y2X0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED16Q9Y2X0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms