Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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