Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI1Q9ULC6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms