Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms