Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ABCF2Q9UG63 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCF2Q9UG63 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms