Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL13Q9P2N7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms