Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms