Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCN3Q9P1Z3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms