Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms