Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SH3BP4Q9P0V3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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