Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNIH4Q9P003 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNIH4Q9P003 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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