Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms