Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDL2Q9NX52 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms