Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms