Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMURF2Q9HAU4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms