Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE41Q9C0J9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms