Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM8Q9BZR9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms