Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms