Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms