Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms