Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms