Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS1Q99742 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms