Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms