Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAT1Q99536 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms