Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3AQ96ST3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms