Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RNF185Q96GF1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms