Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms